方向一：农林重大有害生物和入侵生物内外驱动因子与风险预警

1.昆虫分类与演化研究组（彩万志组）

2.系统与进化昆虫学研究组（杨定组）

3.入侵生物学与害虫生态控制研究组（侯有明组）

4.昆虫演化基因组学研究组（周欣组）

5.昆虫-植物互作研究组（夏吉星组）

6.植病流行与智慧植保研究组（马占鸿组）

7.病毒致病机制组（吴祖建组）

8.实蝇害虫绿色防控组（季清娥组）

9.植物检疫组（胡白石组）

10.蜜蜂分子遗传与行为健康组（苏松坤组）

11.松材线虫病防控研究组（张飞萍组）

12.农业昆虫适应性演化与害虫生态防控研究组（尤士骏组）

13.植物病害遥感监测组（曾也鲁组）

方向二：农林重大有害生物和入侵生物成灾传播规律 

1.病毒-媒介昆虫-植物互作研究组（李毅组）

2.虫媒传播作物病害机制及生态防控团队组（魏太云组）

3.植物抗病遗传组(刘俊组）

4.植物检疫与入侵生物学研究组（李志红组）

5.农林有害生物灾变预警组（胡高组）

6.虫媒生物学研究组（陈倩组）

7.植物-生物互作研究组（杨超组）

8.大豆病害绿色防控研究组（王燕组）

9.真菌致灾与防控研究组（郑文辉组）

10.作物晚疫病抗病机制研究组（孔亮组）

11.植物分子免疫学研究组（郭海龙组）

12.水稻稻瘟病抗性机制与遗传改良组（杨雷云组）

13.植物与病原真菌互作机制研究组（鲁国东组）

14.植物线虫学研究组（李红梅组）

15.昆虫系统学和多样性研究组（黄晓磊组）

16.昆虫与植物互作机制及调控课题组（夏爱组）

17.分子植物病毒学研究组（韩成贵组）

18.害虫绿色防控课题组（刘小侠组）

方向三：农林重大有害生物和入侵生物特异性靶向控制理论基础

1.水稻抗病毒研究组（吴建国组）

2.植物免疫与作物抗病遗传改良研究组（唐定中组）

3.作物表皮调控与病虫害防控组（吴双组）

4.昆虫生理生化与分子生物学组（杜娟组）

5.植物抗病信号传导研究组（王一鸣组）

6.小麦抗病遗传与健康生产组（李刚组）

7.昆虫基因组学与环境适应机制研究组（李虎组）

8.昆虫化学生态与害虫绿色防控研究组（张进组）

9.植物免疫调控与抗病杂交分子育种课题组（杨丽组）

10.稻麦抗病基因资源发掘与利用组（赵文生组）

11.昆虫分子毒理学研究组（王兴亮组）

12.植物抗病与生长信号研究组（赵晶组）

方向四：农林重大有害生物和入侵生物安全防范与精准控制 

1.晚疫病综合防控研究组（董莎萌组）

2.稻瘟病绿色防控组（彭友良组）

3.植物病毒学研究组（陶小荣组）

4.杂草生物学及可持续治理研究组（强胜组）

5.植物病害生物防治与微生态学组（王琦组）

6.农林高危生物防控组（沈杰组）

7.大豆固氮高效改良课题组（陈栩组）

8.农林高危生物防控与绿色有机生产组（闫硕组）

9.小麦赤霉病灾变机制与绿色防控研究组（顾沁组）

10.作物抗性与化学生态学研究组（曾任森组）

11.智慧植保与精准施药研究组（何雄奎组）

12.农药与环境协调研究组(曹永松组)

13.昆虫行为与害虫绿色防控研究组（石旺鹏组）

14.植物线虫鉴定及其病害生态治理组（刘国坤组）

15.昆虫分子生态与进化组（李元喜组）

16.甘蔗病虫害绿色防控研究组（高三基组）

17.有害生物基因防治组（杨广组）

18.重要农林病虫害绿色防控与微生物资源开发利用研究组（邱君志组）

19.农药毒理与抗药性治理研究组（段亚冰组）

20.作物疫病生物防治研究组（景茂峰组）

21.杀菌剂靶标发现及药理学研究组(张峰组)

22.农药环境安全课题组（王鹏组)